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Después de la serie de televisión de Kimagure Orange Road, Kyosuke y Madoka finalmente han llegado al punto en que están cerca de graduarse y deben decidir a qué universidad quieren ir. Naturalmente, quieren ir juntos, así que, además de estudiar, también tienen que buscar una universidad adecuada a la que ambos puedan ingresar.
Hikaru, a quien todavía le falta un año para graduarse, también quiere apoyar a Kyosuke y lo hace a su manera. Pero mientras ella hace eso, Madoka siente celos y le confiesa sus sentimientos a Kyosuke.
Entonces, Kyosuke debe tomar cartas en el asunto para decidir finalmente a la chica que ama... concluyendo así la historia de Kimagure Orange Road.