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Yashiro Isana ha vivido una vida relativamente ordinaria y sencilla. Vive en la tecnológicamente avanzada Ciudad Shizume y asiste a la Escuela Secundaria Ashinaka, una destacada escuela secundaria ubicada en una isla justo fuera de la ciudad. Yashiro es amigable con todos. No parece haber nada malo en él, excepto quizás su hábito de olvidar dónde está su asistente personal de la escuela. Sin embargo, nada normal ha estado sucediendo desde el reciente asesinato de Tatara Totsuka, miembro prominente de la infame HOMRA. Nadie sabe quién exactamente lo mató, pero el hombre responsable tiene una apariencia idéntica y sorprendentemente similar a la de Yashiro. Buscando venganza, los clanes rojos de HOMRA se lanzan a capturar a Yashiro y matarlo. Todos sospechan que Yashiro es el asesino.